Pada tahun 846, Carl Zeiss membuka bengkel kecil untuk pembuatan alat optik ketepatan di 7 Neugasse Street di Jena.
Pada tahun 1866, mikroskop ke-1000 telah dijual. En. ErnstAbbe menyertai syarikat En. Zeiss dan telah menubuhkan teknologi mikroskopi Zeiss secara saintifik.
1884-1891: "Schott & Gemossen Glass Works" di Jena ditubuhkan, Carl Zeiss meninggal dunia pada tahun 1888, Yayasan Carl Zeiss ditubuhkan.
Pada tahun 1900, dengan bantuan En. August Köhler, bengkel kecil En. Zeiss mula berkembang secara global dan, begitu juga, meletakkan asas yang kukuh untuk mikroskop pendarfluor.
Pada tahun 1936, dengan kerjasama En. Frits Zernike, mikroskop kontras fasa pertama untuk analisis sel hidup telah diperkenalkan. Encik Frits Zernike telah dianugerahkan Hadiah Nobel dalam Fizik pada tahun 1953.
1949, Keajaiban Ekonomi dan Zaman Elektronik: Pengkomersilan Mikroskopi Elektron Penghantaran dengan kerjasama AEG Corporation.
Pada tahun 1989, tahap pendigitalan menjadi lebih tinggi dan lebih tinggi, dan mikroskop menjadi stesen kerja pemprosesan imej. Teknologi perisian dan kamera digital yang berkembang pesat mengembangkan bidang aplikasi mikroskop.
Pada tahun 2000, teknologi kawalan operasi membantu teknologi pengimejan, dan mikroskop menjadi sistem paparan imej automatik.
