Langkah-langkah menggunakan mikroskop kontras fasa adalah seperti berikut
① Pilih kanta objektif kontras fasa yang sesuai mengikut sifat dan keperluan spesimen yang akan diperiksa.
②Letakkan slaid spesimen di atas pentas dan laraskan bahagian tengah paksi optik.
③Gunakan teleskop pelarasan sepaksi, laraskan diafragma gelang untuk bertindih sepenuhnya dengan gelang permukaan konjugat pada plat fasa, dan kemudian gantikan kanta mata. Semasa proses pemerhatian, setiap kali gandaan kanta objektif ditukar, adalah perlu untuk melaraskan semula diafragma anulus agar bertepatan dengan gelang permukaan konjugat plat fasa.
④ Tambah penapis hijau dan amati mengikut langkah pengendalian mikroskop optik biasa.
